Fue lanzada en los cines de Japón el 7 de julio de 2001. El corto animado que precede a esta película es Pikachu Pikaboo o también llamado Pikachu juega a las escondidas.

Un cazador Pokémon del pasado intenta atrapar a Celebi con un Houndoom y un Scyther, pero Celebi logra escapar. Celebi, al encontrarse con Sammy Oak, lo traslada al futuro.

En el mismo tiempo que Ash Ketchum y sus amigos están en Johto, un cazador que tiene dark-balls, que consisten en atrapar Pokémon y volverlos malignos, casi parecidas a las cintas del Team Rocket, las utiliza para cazar un Tyranitar. Luego quiere atrapar a Celebi, pero Ash y su Bayleef, con la ayuda de Sammy (Profesor Oak) y su Charmeleon (se cree que fue su Pokémon inicial) combaten contra el Scizor y el Houndoom del cazador. Luego pelean contra el Tyranitar maligno, que fue una pelea agotadora.

Después el cazador consigue atrapar con una Dark Ball a Celebi y lo vuelve malo, al atraparlo, Celebi, comienza a rodearse de plantas pareciendo un monstruo de madera, pero gracias al Team/Equipo Rocket y nuestros héroes Ash, Pikachu, Misty y Brock, Celebi logra despertar de su maldad y vence al cazador del pasado. Al terminar la batalla, Celebi queda débil y lo llevan al lago que dicen que cura Pokémon, pero al meter a Celebi al lago, no se recupera. Después del intento de recuperación, aparece Suicune y purifica el agua, pero tampoco se recupera. Luego todos empiezan a llorar y aparecen los demás Celebi del pasado y futuro, y con sus poderes reviven a Celebi. Luego se van a su siguiente aventura.

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